primer design (7): 프라이머 주문

primer design의 마무리 단계 벌써 해가 지고 있었다. “프라이머 디자인 primer design은 다 했으니,” “이제, 프라이머 주문해 볼게요” 초이는 목이 말라 잠시 물을 한 모금 마시며, 말을 이어갔다. “RT-PCR 실험용 프라이머를 주문하려면 일반적으로 많이 사용하는 평판이 좋은 프라이머 합성 회사를 선정해서, 디자인한 프라이머 시퀀스를 제공하고, 주문해요. 일반적으로 사용하는 프라이머 합성 회사 리스트와 프라이머 주문 방법을 … Read more

primer design (6): Primer-BLAST를 이용하기

“초이야, 배고픈데, 밥 먹고 하자!” 마음 같아선 빨리 프라이머 디자인을 끝내고 싶었지만, 갑자기 배에서 꼬르륵 소리가 나자 민이 말한다. “네에, 선배님!” “내가 살게, 라면 괜찮지?” “음, 전 그냥 밥 먹을게요, 선배님.” “왜? 내가 산다니까?” “전, 밥이 편해서요…” “그래? 나중에 딴 소리 하지 마라?! 고마워서 사준다고 하니깐 싫다고 한 건 너다!” “……” “왜, 대답이 없어?” “네에, … Read more

primer design (4): template이란?

계속해서 초이는 프라이머 디자인primer design을 해서 프라이머가 사용되는 경우를  설명해 주었다. 초이는 먼저, PCR이라고 하는 중합효소 연쇄 반응 (polymerase chain reaction, PCR)에다양한 주형이라고 부르는 템플릿 template이 사용될 수 있다고 덧붙였다. PCR에서 주형(template)은 증폭되는 DNA 서열이다. 프라이머 결합 부위와 PCR의 시작점을 제공한다. 증폭은 내열성 Taq DNA 폴리머라제 효소에 의해 이루어진다. Genomic DNA, plasmid DNA, cDNA 또는 … Read more

primer design (3): 프라이머란?

민은 초이와 함께 초이 컴퓨터 앞에 나란히 앉아 모니터를 바라보고 있다. 초이는 primer design에서 프라이머에 대해 찬찬히 설명해 준다. “알어, 알어, 그렇지, 맞아~아는 얘기야” 민은 초이 설명 중간 중간에 맞장구를 치며, 이미 알고 있는 내용이라고 재차 말한다. primer design에서 프라이머란? ” 프라이머는 간단히 말해서 DNA 합성의 시작점이 되는 짧은 유전자 서열 조각이에요. 중합효소연쇄반응(PCR), DNA 서열분석(sequencing) … Read more

primer design (2): 초이야 수고했어

이전 글 primer design 하라고? PCR 프라이머 쥐어 짜기 민은 1학기 먼저 입학했다며 그 동안 초이에게 선배 티를 팍팍낸다. 그러던중 지도 교수 K는 민에게 논문에 필요한  PCR용 primer design 하라고 하고, 민이 이 일이 생각보다 쉽지 않음을 느끼던 차에. 초이가 이전 연구실에서 주로 프라이머를 디자인하고 PCR을 했다는 것을 건너 건너 들어 알게 되고,  민은 초이에게 그 전과 달리 살갑게 대하는데… 초이야 수고 했어, 이거 … Read more

primer design (1): 초이와 민이 만나다!

‘초이’의 신생랩 생활 여기 ‘초이’의 신생랩 생활을 따라가 보자. 1학기 늦게 입학한 초이, 선배 민을 만나 랩 생활을 같이 하게 된다. 여기에서 primer의 정의, primer design 하는 법에서 주문하는 방법에 대해 눈 요기 해 보자. 초이의 primer design 도전기 초이는 살짝 긴장되었다. 학부 졸업 후 6개월간  oo 연구소에서 보조 연구원으로 일하다 한계를 느껴 공부를 더 … Read more