이번 글에서는 Primer Database인 PrimerBank에 대한 설명과 PrimerBank사용법을 TP53을 예로 간략하게 살펴보고자 한다. 실험적으로 검증된 프라이머 은행? PrimerBank 사용법 PrimerBank의 특징과 장점 PrimerBank는 PCR 프라이머에 대한 공개 데이터베이스이다. 이곳에서 제시하는 프라이머는 유전자 발현 분석과 real-time PCR을 위한 것으로 가장 잘 알려진 인간 및 마우스 유전자를 포함하여 약 306,800개 이상의 프라이머 데이터를 제공하고 있다고 한다. 앞선 … Read more
이번 시간에는 Real-time PCR과 파레토법칙에 대해 생각해 보고자 한다. 간단한 듯 까다로운 Real-time PCR Real-time PCR은 실시간으로 PCR 산물의 생성을 형광을 통해 감지하여 시료 내에 존재하는 특정 유전자의 상대적 양을 분석하는 실험 기법이다. 여기에는 Taqman기반 또는 SYBR기반 Real-time PCR이 주로 사용되는데, 특히 SYBR 기반 Real-time PCR은 Taqman 기반법에 비해 비교적 저렴하고 쉽게 접근하여 분석할 수 … Read more
이번 글에서는 Real-time PCR SYBR 시약3사를 알아보고자 한다. 1. 어떤 키트를 선택할까요: 시료, 표적 유전자, 검출 화학 유형에 따라 실험에 적합한 qPCR 키트를 선택하는 것은 시료 유형, 표적 유전자 및 검출 방법을 포함한 여러 요인에 따라 달라진다. 실험에 적합한 qPCR 키트를 선택하는 데 도움이 되는 몇 가지 내용을 공유해 본다. 시료 유형은 무엇인가: 샘플 유형에 … Read more
지난 글에서 real-time PCR에서 자주 만나는 상위 문제 10가지와 해결법에 대해 생각해 보았다. Real-time PCR에서 상위 10가지 문제와 해결법 그리고, SYBR 기반 시약 회사를 알아 보았다. 이번 글에서는 real-time PCR Ct 값으로 fold change 구하는 법을 알아 보고자 한다. 이 방법은 논문에서 자주 사용되는 Control군 대비 Test군의 target gene 발현을 상대적으로 비교하는 방법이다. 1. real-time … Read more
